Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms