Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Psma6Q9QUM9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psma6Q9QUM9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psma6Q9QUM9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psma6Q9QUM9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psma6Q9QUM9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psma6Q9QUM9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psma6Q9QUM9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psma6Q9QUM9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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