Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms