Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms