Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms