Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms