Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms