Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms