Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms