Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms