Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms