Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00116Q8NCU8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms