Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms