Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms