Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms