Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU64

CFAP65, Cilia- and flagella-associated protein 65, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP65Q6ZU64 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP65Q6ZU64 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP65Q6ZU64 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms