Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

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Length 5,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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RNF213Q63HN8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF213Q63HN8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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