Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms