Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC158Q5M9N0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms