Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms