Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF8Q3BBV2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms