Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNB1Q14721 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms