Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
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