Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms