Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms