Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP7P55210 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP7P55210 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP7P55210 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP7P55210 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms