Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SMARCA4P51532 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms