Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms