Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms