Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5CP41229 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms