Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms