Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9AO75110 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9AO75110 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9AO75110 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9AO75110 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms