Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUBNO60494 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUBNO60494 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUBNO60494 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUBNO60494 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUBNO60494 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms