Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms