Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms