Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCAO15360 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FANCAO15360 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
FANCAO15360 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
FANCAO15360 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCAO15360 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCAO15360 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCAO15360 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCAO15360 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCAO15360 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCAO15360 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms