Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPATO15228 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPATO15228 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPATO15228 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPATO15228 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPATO15228 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNPATO15228 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNPATO15228 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPATO15228 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms