Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DFFAO00273 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DFFAO00273 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DFFAO00273 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DFFAO00273 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DFFAO00273 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DFFAO00273 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DFFAO00273 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms