Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms