Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms