Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms