Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms