Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PHACTR1Q9C0D0 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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