Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms