Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms