Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms