Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms