Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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CNGB1Q14028 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CNGB1Q14028 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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