Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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