Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CYP4A22-203ENST00000371891 2535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL356289.3-201ENST00000640049 2669 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ESCO2-201ENST00000305188 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC009090.4-201ENST00000623921 3691 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 HIGD1B-205ENST00000591513 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL136967.1-201ENST00000625120 441 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 AP004245.1-201ENST00000530434 259 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 IGHV1OR15-4-201ENST00000560037 348 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC134981.1-201ENST00000628076 348 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 LAX1-203ENST00000442561 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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